1.氯气消毒原理如下：
氯溶于水后起下列反应：
Cl2+H2O→HOCl+H++Cl-
HOClDH++OCl-
在水中水解成次氯酸，氯的杀菌作用，主要是次氯酸体积小，易穿过细胞壁；同时，它又是一种强氧化剂，能损害细胞膜，使蛋白质、RNA和DNA等物质释出，并影响多种酶系统(主要是磷酸葡萄糖脱氢酶的巯基被氧化破坏)，从而使细菌死亡。氯对病毒的作用，在于对核酸的致死性损害。上述反应是可逆反应，因而一氯胺和二氯胺的杀菌原理仍是次氯酸的作用，只是在次氯酸被消耗后，反应才向左进行；氯胺本身也有杀菌作用，但需较高的浓度和接触时间。所以国家标准要求，使用氯气等含氯消毒剂消毒，需要在管网末端检测到余氯。
2.二氧化氯杀菌的机理
细菌表面带有一定的负电荷，这些负电荷可以避免细胞受到带负电的杀菌的影响。ClO2以中性单分子形态存在并进入细胞内部，其杀菌效果不受细胞表面负电性的影响。从进入细胞内部的方式来看，ClO2透过细胞膜的方式可能为单纯扩散，不需要载体蛋白(渗透酶)参与，所以无论细菌的代谢活力如何，ClO2均可起到杀菌的作用。另外ClO2能破坏微生物的葡萄糖氧化酶，使其不能参加氧化还原活动并导致细胞的代谢机能发生障碍。ClO2还可与细菌中的部分氨基酸发生氧化还原反应，使氨基酸分解破坏，进而控制蛋白质的合成，最终导致细菌死亡，也可杀灭芽孢。二氧化氯杀菌消毒效果快，在管网末端检测不到余氯残留。
所以使用不同杀菌剂的效果和检测方法是不同的。
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