1生石灰生石灰(CaO)，加水吸湿后生成氢氧化钙(Ca(OH)2)，呈碱性，pH值达11～12，同时释放出大量热能，从而杀灭野杂鱼、鱼卵、虾蟹类、昆虫、致病细菌、病毒等，并能使水澄清，还能增加水体钙肥，提高水体的pH值。一般用于放养前清塘，用量为～kg/m2，失效时间为7～8d；在养殖期间，用于升高塘水pH值。使水提升1单位pH值的用量为10ppm。
2漂白粉漂白粉为白色颗粒状粉末，其吸收水份或二氧化碳时，产生大量的氯，因而杀菌效果比生石灰强。但露空时，氯易散失而失效。漂白粉是使用了多年的第1代消毒剂。一般用于放养前的水体消毒和养殖过程中的水体消毒，前者使用浓度为20～30ppm，后者一般使用1～2ppm。用于消毒的漂白粉，应使用含氯量达到32%以上的，含氯量低于25%的不能使用，失效时间为4～5d。
3强氯精强氯精的化学名称为三氯异氰尿酸，为白色粉末，含有效氯达60%～85%，其化学结构稳定，能长期存放，1～2年不变质。在水中分解为异氰尿酸、次氯酸，并释放出游离氯，能杀灭水中各种病原体，强氯精可称为第2代消毒剂。强氯精的出现，逐步代替了漂白粉的使用。通常用于放养前的水体消毒和养殖期间的水体消毒，前者使用浓度1～2ppm，后者为0.15～0.20ppm。失效时间为2d。
4二氯异氰尿酸钠二氯异氰尿酸钠为白色晶粉，含有效氯60%～64%，其化学结构稳定，比漂白粉有效期长4～5倍。一般室内存放半年后仅降低有效氯含量的40.16%。易溶于水。在水中逐步产生次氯酸。由于次氯酸有较强的氧化作用，极易作用于菌体蛋白而使细菌死亡，从而杀灭水体中的各种细菌、病毒。二氯异氰尿酸可称为第3代水体消毒剂。养殖中后期的水体消毒，应首选此药物。使用浓度为0.2ppm。失效时间为2d。
5二氧化氯制剂市面上销售的二氧化氯有固体和液体的。固体二氧化氯为白色粉末，分A、B两药，即主药和催化剂。使用时分别将A、B药加水溶化，混合后稀释，即发生化学反应，放出大量的游离氯和氧气，达到杀菌消毒效果。水剂的稳定性二氧化氯使用效果更好。二氧化氯制剂可称为第4代水体消毒剂，其还可以用于虾鲜活饵料的消毒。前者使用浓度为0.1～0.2ppm，后者为～ppm。失效时间为1～2d。
6碘碘又称碘片，是由海草灰或盐冈中提取，为灰黑色或兰黑色片状结晶。不溶于水，易溶于乙醇。其醇溶液溶解于水，能氧化病原体原浆蛋白的活性基因，对细菌、病毒有强大的杀灭作用。在水产养殖水体消毒中，一般使用碘的化合物或复合物。我国已生产PVP-1，其消毒浓度为ppm。碘与汞相遇产生有毒的碘化高汞，必须特别注意。
7敌百虫敌百虫是一种有机磷酸酯。为白色结晶，易溶于水。其作用主要为抑制胆碱酯酶活性，使用浓度为2.0～2.5ppm，对鱼类杀伤力大。常用于放养前的清塘，以杀灭塘中敌害鱼类、白虾及蟹类。
8茶子饼茶子饼在两广俗称茶麸，是油茶榨油后的残渣。市面上销售的茶麸有大块的和小片状的。其含皂角甙10%～15%，对鱼类的杀伤力大。常用于放养前的清塘，以杀灭塘中敌害鱼类及鱼卵。也可用于养殖过程中的中间清塘，以杀灭混入塘中的敌害鱼类。前者一般使用15～20kg/m2，后者一般使用15～20ppm，失效时间为2～3d。
9高锰酸钾高锰酸钾又名灰锰氧，深褐色结晶体，易溶于水。本品为强氧化剂，氧化微生物体内活性基因而杀菌。还可以杀死原生动物。一般不用于养殖期间的水体消毒，只用于杀灭纤毛虫。使用时减去大部分塘水，按3～5ppm浓度用药。4h后把水进满。
10新洁尔灭液本品又名新洁尔灭、溴苄烷胺，为溴苄化二甲基苄基烃铵的水溶液。无色或淡黄色的澄清液体，芳香味苦。其渗入细胞膜的类脂层，改变细胞膜的通透性，使细胞内物质外渗而杀灭细菌、原生动物。在养虾过程中，用高锰酸钾杀灭纤毛虫时，同时使用0.1ppm的新洁尔灭效果更好。
消毒有风险，结合当地的情况，天气，温度情况选择消毒方式及剂量。
高密度消毒的时候，排污管道是消毒的死角，消毒过程重点考虑，否则消毒不彻底，效果不理想，容易反复。
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